La historia de El Portil es similar a la historia de la provincia de Huelva, y en la provincia hay una fecha que destaca sobre las demás, la de 1492, el año del descubrimiento. Un descubrimiento que zarpó de los puertos onubenses, en concreto desde Palos de la Frontera hacia la conquista de las Indias.

Pero antes, fenicios, tartessos, íberos, romanos y musulmanes ya habían poblado estas tierras. La riqueza de esta tierra y de sus minas le hacían ser un punto de interés para el desarrollo de cualquier civilización. Huelva, también llamada Onuba, comenzó su desarrollo más importante con los romanos, quienes fundaron La Palma del Condado, el Puente de Niebla sobre el Odiel y estuvieron explotando las minas de Río Tinto hasta el siglo V de nuestra era.

En el siglo VIII llegaron los árabes y su peculiar civilización, poblando de fortalezas y mezquitas todo el litoral y el interior de la provincia, dejando impregnado su aroma en las localidades, en concreto en Niebla, ciudad que llegó a ser la capital de la zona.

La Reconquista llegó de la mano de Alfonso X El Sabio en 1262, reconquistando Niebla, ciudad más importante de los musulmanes. Más tarde, Cristóbal Colón, el marino encargado de ir a las Indias, se hospedó en el Monasterio de Santa María la Rábida. La provincia estaba a punto de escribir sus páginas más doradas. En 1492 los Reyes Católicos dieron la autorización y tres embarcaciones, la Pinta, La Niña y la Santa María, zarparon en dirección a las Indias sin saber lo que el futuro les depararía.

Siglos después a este momento histórico, llegó un punto negro, un año trágico a la costa onubense, el terremoto de Lisboa sacudió toda la Costa de la Luz, y la provincia de Huelva quedó seriamente dañada, con destrozos en el legado que durante siglos habían dejado aquí romanos, árabes y demás civilizaciones.

Las Minas de Río Tinto volvieron a ser explotadas por los ingleses nuevamente en el siglo XIX.

Sobre el Portil, podemos decir que estamos ante un núcleo urbano muy joven, creado alrededor de una de las mejores playas de la Costa de la Luz y de el Paraje natural de las Lagunas del Portil.